Если вылетает по проверке "php_sapi_name() != 'cli'" - то, вероятно, бинарник /usr/bin/php - чистый cgi, а cli-версия, к примеру, лежит рядом и называется /usr/bin/php-cli (или вообще отсутствует). А в винде php.exe умеет и cgi, и cli.

Надо смотреть, что за php на этом юникс-сервере стоит.