Хм. Получается, что таки cli. А что конкретно в post-commit.php в строках 16 и 17? Потому что похоже, что судя по вот этому:

received JSON: Testing Integration, issue #3126

Notice: Trying to get property of non-object in /home/viewbix/public_html/bugs/scripts/post-commit.php on line 16

Получает он вовсе не JSON, и соответственно json_decode возвращает false, который потом пытаются использовать, как обьект, что не получается.

А вот это:
sh: fork: retry: Resource temporarily unavailable

Означает, что на машине слишком много процессов бежит, и новые запускать не удаётся. Почему, трудно сказать.